Em mais uma edição do ‘Drops de Genômica’, o oncologista André Murad (foto) as assinaturas bioquímicas de controle gênico definidas pela Enciclopédia de Elementos de DNA (ENCODE).

Por André Marcio Murad*

ENCODE é um projeto público de pesquisa que visa construir uma lista abrangente de partes de elementos funcionais no genoma humano, além de apoiar projetos de pesquisas biomédicas através de recursos comunitários de dados genômicos, software, ferramentas e métodos para análise de dados e produtos resultantes de análises e interpretações de dados.

A ENCODE utiliza uma definição de função epigenética para assinaturas bioquímicas. As assinaturas bioquímicas incluem padrões de metilação de sequências de DNA; modificações de histonas na cromatina; sensibilidade à DNase I, que sugere regiões de atividade transcricional; sítios de ligação do fator de transcrição; sequências identificadas como promotores; produção de transcrições codificantes ou não codificantes (NcRNAs); e elementos regulatórios de longo alcance, como intensificadores e interações de cromatina de longo alcance.

Geralmente, a modificação da acetilação de histonas está relacionada à ativação de genes, enquanto a hipermetilação do DNA está relacionada ao seu silenciamento. As modificações do RNA regulam a expressão gênica mediando o metabolismo do RNA. Os NcRNAs, como o microRNA, fazem a mediação da regulação epigenética da expressão gênica, guiando complexos contendo argonautas para andaimes de RNA nascentes complementares.